De acuerdo con el Ejército Zapatista de Liberación Nacional (EZLN), Ruiz García padeció hostigamiento, incluso antes de su alzamiento en 1994.
El EZLN manifestó su pesar por la muerte del obispo emérito Samuel Ruiz García y reconoció su compromiso y trayectoria como individuo, y como representante de toda una corriente dentro de la Iglesia Católica.
En un comunicado firmado por los autodenominados subcomandante 'Marcos' y el teniente coronel 'Moisés', reconoce que don Samuel no solamente destacó en un catolicismo practicado con los desposeídos, sino también que con su equipo 'formó toda una generación de cristianos comprometidos con esa práctica de la religión católica'.
Los zapatistas reconocieron que 'no sólo se preocupó por la grave situación de miseria y marginación de los pueblos originarios de Chiapas, además trabajó junto con un heroico equipo pastoral por mejorar esas indignas condiciones de vida y muerte'.
De acuerdo con el Ejército Zapatista de Liberación Nacional (EZLN), Ruiz García padeció hostigamiento, incluso antes de su alzamiento en 1994. También mencionan que durante su trabajo en la Comisión Nacional de Intermediación (Conai), 'don Samuel recibió presiones, hostigamiento y amenazas'.
Destacaron que por encima de estos ataques 'don Samuel Ruiz García y los cristianos como él, tuvieron, tienen y tendrán un lugar especial en el moreno corazón de las comunidades indígenas zapatistas'.
En el documento saludaron a los cristianos de todo el mundo que como don Samuel 'no guardan un silencio cómplice frente a la injusticia, ni permanecen inmóviles frente a la guerra'.
'Se va don Samuel, pero quedan muchas otras, muchos otros que, en y por la fe católica cristiana, luchan por un mundo terrenal más justo, más libre, más democrático, es decir, por un mundo mejor. Salud a ellas y ellos, porque de sus desvelos también se nacerá el mañana'.
