En la denuncia penal que alista la Comisión Nacional de los Derechos Humanos (CNDH) contra mandos de la Policía Federal (PF) por el caso Ayotzinapa se señala a seis jefes de alto nivel de la corporación, incluyendo al excomisionado general Facundo Rosas, por las deficiencias en su actuación, como permitir abuso de la fuerza, ya que peritajes realizados por la Procuraduría General de la República (PGR) revelan que 22 armas disparadas el día de los hechos pertenecían a los agentes federales.
A partir de la investigación que realizó el organismo nacional en torno al fallido operativo del 12 de diciembre de 2011 en la Autopista del Sol, en el que perdieron la vida dos estudiantes de la Escuela Normal Rural "Isidro Burgos" de Ayotzinapa, Guerrero, y en el que 52 personas fueron victimizadas, se estableció la línea de mando de la PF que tuvo a su cargo el despliegue de elementos que incurrieron en anomalías durante su intervención.
De acuerdo con el informe final del caso Ayotzinapa que integró la Primera Visitaduría, a partir de las constancias que recabó y que integran casi 16 mil fojas de expediente, existen elementos para presentar una denuncia penal en la PGR contra los mandos de la Policía Federal que estuvieron a cargo del operativo.
Se detalla que además de las omisiones cometidas por el excomisionado general de la PF Facundo Rosas, quien se enteró una hora tarde de lo ocurrido, cuando ya se habían registrado enfrentamientos, muertos y sus elementos habían golpeado y detenido a manifestantes, otros cinco mandos fueron identificados directamente como responsables de la incursión.
