Es la encargada de administrar recursos federales al desarrollo rural. Además, fomenta la investigación para fines rurales (incluyendo semillas, plantas, entre otros), regula las actividades relacionadas con la pesca y tiene en su control todas las medicinas y alimentos para animales domésticos y de granja. Fomenta, como actividad extra, todas las artesanías rurales.
De acuerdo con la Ley Orgánica de la Administración Pública Federal en el Artículo 35 le corresponde el despacho de las siguientes funciones: Formular, conducir y evaluar la política general de desarrollo rural, a fin de elevar el nivel de vida de las familias que habitan en el campo, en coordinación con las dependencias competentes. Integrar e impulsar proyectos de inversión que permitan canalizar, productivamente, recursos públicos y privados al gasto social en el sector rural; coordinar y ejecutar la política nacional para crear y apoyar empresas que asocien a grupos de productores rurales a través de las acciones de planeación, programación, concertación, coordinación; de aplicación, recuperación y revolvencia de recursos, para ser destinados a los mismos fines; así como de asistencia técnica y de otros medios que se requieran para ese propósito, con la intervención de las dependencias y entidades de la Administración Pública Federal correspondientes y de los gobiernos estatales y municipales, y con la participación de los sectores social y privado. Organizar y fomentar las investigaciones agrícolas, ganaderas, avícolas, apícolas y silvícolas, estableciendo institutos experimentales, laboratorios, estaciones de cría, semilleros y viveros, vinculándose a las instituciones de educación superior de las localidades que correspondan. Fomentar y organizar la producción económica del artesanado, de las artes populares y de las industrias familiares del sector rural, con la participación que corresponda a otras dependencias o entidades. Elaborar, actualizar y difundir un banco de proyectos y oportunidades de inversión en el sector rural. Organizar y mantener al corriente los estudios económicos sobre la vida rural, con objeto de establecer los medios y procedimientos para mejorarla. Fomentar la actividad pesquera. Entre otras. Conforme a lo dispuesto por el artículo 3° del Reglamento Interior de la Sagarpa la representación, trámite y resolución de los asuntos competencia de la Secretaría, corresponde originalmente al secretario del Despacho, quien para el estudio, planeación y despacho de sus atribuciones, contará con los siguientes:
Servidores públicos y unidades administrativas: ecretario del Despacho; subsecretario de Agricultura; subsecretario de Desarrollo Rural; subsecretario de Fomento a los Agronegocios; oficial mayor; Coordinación General de Enlace y Operación; Coordinación General de Comunicación Social; Coordinación General de Delegaciones; Coordinación General de Política Sectorial; Coordinación General Jurídica; Coordinación General de Ganadería; Dirección General de Fomento a la Agricultura; Dirección General de Vinculación y Desarrollo Tecnológico; Dirección General de Apoyos para el Desarrollo Rural; Dirección General de Programas Regionales y Organización Rural; Dirección General de Estudios para el Desarrollo Rural; Dirección General de Servicios Profesionales para el Desarrollo Rural; Dirección General de Estudios Agropecuarios y Pesqueros; Dirección General de Administración de Riesgos y Proyectos de Inversión; Dirección General de Apoyo al Financiamiento Rural; Dirección General de Eficiencia Financiera y Rendición de Cuentas; Dirección General de Desarrollo Humano y Profesionalización; Dirección General de Proveeduría y Racionalización de Bienes y Servicios; Dirección General de Promoción de la Eficiencia y Calidad de los Servicios; Órganos administrativos, desconcentrados y Entidades[editar] Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria; Servicio Nacional de Inspección y Certificación de Semillas; Colegio Superior Agropecuario del Estado de Guerrero; Apoyos y Servicios a la Comercialización Agropecuaria; Servicio de Información Agroalimentaria y Pesquera; Tipo Inspección Federal; Instituto Nacional de Pesca; Comisión Nacional de Acuacultura y Pesca; Unión Nacional de Avicultores; Consejo Mexicano del Café; Comité Nacional para el Desarrollo Sustentable de la Caña de Azúcar; Universidad Autónoma Chapingo; Colegio de Postgraduados; Comisión Nacional de las Zonas Áridas; Alianza para el Campo; Fideicomiso de Riesgo Compartido; Fondo de Empresas Expropiadas del Sector Azucarero; Instituto Nacional para el Desarrollo de Capacidades del Sector Rural; Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas Y Pecuarias